apa yg dimaksud dengan menon-aktifkan produk? Jika yg dimaksud adalah produk masih ingin ditampilkan tapi sudah tidak bisa dibeli maka tinggal manage stock-nya menjadi out of stock.

bukan pak. jadi ketika membeli produk tertentu. misal produk A. nah si plugin ongkir ini non aktif, soalnya mau mengaktifkan ongkir flat rate (Shipping Class / Zone) bawaan woocommercenya

Halo

Utk settingan per-produk seperti nya plugin ongkir tidak bisa pak 🙂

Coba berikan saja keterangan di produk tsb kalau bisa menggunakan flat ongkir, dan sediakan opsi flat ongkir pada halaman check out 🙂

Trims

Kalau itu pengaturan dari woocommercenya bukan dari plugin ongkirnya. Tinggal set aja flat rate di woocommercenya.
Ini referensi yg barangkali bisa membantu
https://docs.woocommerce.com/document/flat-rate-shipping/#section-4